医药医疗
平台介绍
超级计算机在探究基因奥秘、蛋白质结构、生物信息以及药物设计等方面已经成为不可或缺的工具。
深圳超算强大的计算能力和完善的技术支持,可以帮助用户分析和处理生命科学中的海量数据,平台支持横跨分子生物学、合成生物学、细胞生物学、系统生物学、生物信息学、生物医学、基因组学等多个生命科学相关学科的研究。用户可以利用该平台从微观到宏观,个体到系统等多尺度系统地解决生命科学中的各种问题。
该平台通过软硬件相结合,打造了一个集生物信息分析、药物设计和筛选、医学大数据分析和数据挖掘一体化的一站式服务平台。该平台为公众卫生健康、个性化医疗和相关学术研究提供服务和技术支持。
具体来说,该平台可以为用户提供以下服务:
生物信息分析:提供基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学等生物信息分析工具和服务;
药物设计和筛选:提供虚拟筛选、分子对接、自由能计算等药物设计和筛选工具和服务;
医学大数据分析和数据挖掘:提供医学影像分析、电子病历分析、人群健康数据分析等医学大数据分析和数据挖掘工具和服务。
技术特点
本平台支持广泛的生物大分子研究,包括结构模拟、功能预测、药物设计、蛋白质结构预测和相互作用网络分析等。采用多种方法学,涵盖分子动力学、第一性原理、字符串处理、图论、贝叶斯模型、高斯模型、马尔可夫预测模型、数学统计、数值模拟和数据挖掘等技术。本平台支持并行计算,可以利用多CPU核、多计算节点和GPU加速卡进行计算。这些技术优势有助于缩短分析研究时间,使研究更为高效。
典型案例
以往局限于高精度自由能微扰计算所需要的巨大计算量很难批量计算,在深圳超算中心的支持下中山大学药学院罗海彬团队也在PNAS上报道首次利用高精度自由能微扰计算对现有药物针对新冠病毒做了100个左右药物-靶标的精准结合自由能计算并取得较好结果。
分类软件
分类 | 软件名称 | 版本 |
生物医药—药物设计 | SYBYL | 2.0 |
生物医药—药物设计 | Discovery Studio | 4.0 |